武警乌鲁木齐指挥学院的前身是武警乌鲁木齐指挥学校,组建于1983年,是国务院、中央军委、武警总部批准的新疆唯一一所武警初级指挥学校。建院20余年来,为驻新疆武警部队内卫、边防、消防、兵团指挥部、8660部队培养输送了大批军事人才。目前,武警新疆总队、武警兵团指挥部所属单位90%以上的干部,是武警乌鲁木齐指挥学院毕业的学员,其中一部分已走上团职领导岗位。2006年武警部队院校编制体制调整,学院扩编为正师级单位,更名为武警乌鲁木齐指挥学院,并由原来的专科教育升格为本科教育,实现了“办学规模化、教学现代化、管理正规化”的总体目标。
2003年经武警总部批准,武警乌鲁木齐指挥学院与新疆大学联合办学,由新疆大学教学经验丰富、学术水平高的40余名教授、副教授、讲师担任基础文化课教员。现有博士生学历的7人,占总数的4.2%,研究生学历的23人。师资力量雄厚,教学设施先进,是广大青年学生献身国防事业、立志成才的基地,是武警部队培养警官的摇篮。
学院教学区设有教学楼、办公楼、军人礼堂、图书馆、训练场。建成了校园网,拥有科技含量较高的现代化教学科研设施。即计算机中心、电化教学中心、网络管理中心、多媒体教室、电子图书阅览室、多媒体学术报告厅等。有规范的障碍、器械、田径、射击场,有配套的多功能健身训练厅和文化娱乐中心。依托地方大学联合办学,实现了资源共享。