安庆医药高等专科学校是经国家教育部、安徽省人民政府批准设立的全日制普通高等专科学校，其前身为安徽省安庆卫生学校。学校1943年创办于当时安徽省临时政府所在地立煌县（今金寨县），原名安徽省立立煌高级助产护士职业学校，是安徽省最早的公办医学教育学校。1945年增设药剂专业，更名为安徽省立立煌高级医事职业学校，开全省药学教育先河。1946年元月迁至合肥，同年2月迁至安庆，更名为安徽省省立安庆高级医事职业学校。1952年定名为安徽省安庆卫生学校。1958年5月经省人民政府批准，在安庆卫生学校基础上开办“安庆医学专科学校”，招生3期，办学4年，至1962年7月，按省高校调整方案停止招收专科生。60多年来，学校培养了16000余名学子。1993年，时任卫生部部长陈敏章为建校五十周年题词：知命之年，桃李芬芳。
目前，学校占地面积537.79亩（其中新校区500亩），校舍建筑面积101100平方米。教学仪器设备总值1487万元，纸质图书16.92万册，电子图书2万册。专任教师133人，其中高级职称占43%。建有校办药厂、门诊部，有1所附属医院（二级甲等）和3所县级综合性临床教学医院。
学校现开设药学、药品经营与管理、药物制剂技术、生物制药技术、临床医学、康复医疗技术、助产、护理等8个专科专业；药剂、药品营销、生物技术制药、护理、卫生保健、康复技术、口腔工艺、中医、助产等9个中专专业，其中药剂专业是安徽省示范专业。2007年招收全日制普通专科1200人，五年制高职240人，普通中专650人。学校积极拓宽办学渠道，先后与安徽医科大学、蚌埠医学院、安徽中医学院、安庆电视大学开展联合办学，开设五年制高职教育，举办成人业余专科、本科、研究生课程进修班等层次的教育。学校办学规模、办学层次和办学质量不断提升。
学校将以 “三个代表”重要思想为指导，积极落实科学发展观，贯彻党的教育方针，坚持以教学为中心，树立以人为本、质量兴校的办学理念，积极构建和谐校园，努力提高教学质量和办学效益。全体师生满怀信心、积极进取，开创安庆医药高等专科学校辉煌的明天。