福建生物工程职业技术学院是经省委、省政府批准并报国家教育部同意设立，是全省唯一一所医药、生物类全日制国家公办高等大专院校，现隶属于福建省食品药品监督管理局，业务由国家教育行政主管部门指导。学院地处福建省福州市区的闽江之畔、洪山桥旁，环境优美，交通便捷，学习、生活设施配套齐全。学生毕业时颁发国家统一的普通高等学校毕业证书。
学院现占地150多亩（新校区将征地308亩），设有7个系11个专业，设置有省级精品专业和精品课程。各类在校生近5000人。学院拥有一支作风优良、业务过硬、比例均衡、结构合理的教师队伍，在现有的教师队伍中，具有“双师型”的教师占45%。另外还从省内的有关高校、企事业单位中长期聘请在医药、生物、食品等专业技术上有造诣的专家、教授到我校任教。
学院教学实验实训仪器先进，建有能满足各专业、学科实验教学需求的三十五个专业实验室；拥有校园快速宽带计算机局域网、多功能学术报告厅、卫星有线电视电教中心、无线自动外语播收系统、多媒体演示教室、图书馆、电子阅览室等；建有药品生产GMP教学实验厂、食品保健品调制实验场、中药饮片加工实验场、全省一流品种齐全的中药标本馆、武夷山齐云峰自然博物园中药种植基地以及三家已通过GSP认证的校办企业——福建省闽药经济开发公司、福建金山医药超市和福建医药学校耀效医药商店以及福建省药品检验所、福州制药厂、南京军区福州总院、厦门医药有限公司、福州同春药业股份有限公司等学生实习、实训基地。
学院设有国家职业技能鉴定站，实行“双证制”（即毕业证书和职业技能证书），注重学生的综合素质教育，充分发挥医药生物办学特色。学院坚持“发展创新”的办学理念，“用发展的眼光看待学生，用创新的意识培养人才”，进一步拓宽办学路子，开展多层次、多渠道多形式办学。现有自办成人大专，并与省内外知名本科大学联办本科函授学历教育，联办生物工程专业、中草药专业硕士研究生学历教育教学站。开通了“专升本直通车”，形成了较为完善的普通教育与继续教育相衔接的“立交桥”教育体系，不断提高教学质量和办学效益，为海峡西岸经济区的建设和发展培养应用型、技能型高素质人才和“现场药师”、“现场工程师”。学院已经逐步建立起国家奖学金、国家助学奖学金、国家勤学奖贷款、国家助学贷款、学院奖学金、勤工助学金、减免缓学费、学院春蕾助学金等多种形式，金额发放有每年8000元、5000元、3000元、1500元、1000元、500元等不同档次，并开辟了贫困生入学绿色通道，确保每位贫困生不因经济困难而失学。学院与省内外150多家食品、医药、生物等工商企事业单位建立良好的实习就业合作关系，就业渠道宽敞，毕业生就业率连续多年保持在98%以上。历年来已培养高、中级专门人才一万多名，许多毕业生已成为省内外食品药品监督管理系统和医药卫生工商企事业单位的专业骨干，在社会中享有较高声誉。